Ekrem Bajroviqi është dënuar me 12 vjet burgim nga drejtësia e Kosovës.
Bajroviqi është shpallur fajtor për krime lufte në Kosovë në vitet 1998-1999, në Istog dhe në fshatrat përreth.
Ai ka qenë i implikuar në vrasjen, bastistjen, rrahje, maltretim tortura dhe trajtim në mënyrë çnjerëzore të popullatës civile